Laboratorní deník a sklad pro akademické výzkumné skupiny

Laboratorní deník, který ví, kde je každá zkumavka.

SLIM propojí každý záznam se skutečným vzorkem, přesnou verzí protokolu a přístrojem, na kterém běžel, takže se nic neztratí, ani když lidé odejdou. Vaše tabulky do něj převedeme za vás.

Domluvit 30min ukázku Ceník

Pošlete nám předem tabulku a na hovoru uvidíte v SLIMu svou vlastní laboratoř. Bez karty, bez prezentace.

V provozu v Ústavu experimentální botaniky AV ČR Od 4 000 Kč / měsíc za laboratoř, neomezeně lidí Převod dat v ceně GDPR, smlouva o zpracování dat
Genomika  ·  Laboratorní deník Otevřeno

Promytí a nové nanesení, druhá cela

Daniel Pondělíček · 18. září 2026

Opakované použití průtokových cel

Druhá cela pokusu. Promyto kitem ONT, před nanesením spočítány póry: 640 aktivních, oproti 1 190 u první cely minulý týden. Stejná knihovna, vstup 1 ng, nanesena na FC-1034.

FC-1034
Flow Cells
LotLOT-94079
Active pores2100
Expiry date2026-09-04
QC passed✓
Nanopore ligation sequencing v3
Step 4
Load
Inputs
Flush bufferSequencing buffer
Machines
MinION
Outputs
Loaded flow cell

Zní vám to povědomě?

Tři věci, které se v každé laboratoři stanou každý měsíc.

Recenzent chce detail, který nikdo nezapsal.

Výsledek je v grafu, ale šarže, koncentrace ani nastavení přístroje se do deníku nedostaly, protože zapisovat všechno trvalo příliš dlouho.

SLIM: zkumavku, protokol i přístroj připojíte několika stisky kláves, takže se celý kontext zapíše rovnou při práci.

Potřebný materiál nejde najít.

Někdo přesunul krabičku, popisek je rozmazaný a v tabulce stojí mrazák 2, i když je to v mrazáku 3. Dvacet minut u dveří mrazáku.

SLIM: každá položka má pozici, vlastníka a NFC štítek. Přiložíte telefon a víte, co to je a kam to patří.

Dva lidé si zarezervovali stejný přístroj na stejný čas.

Papír na dveřích říká jedno, sdílený kalendář druhé. Něčí vzorky čekají a něčí den je pryč.

SLIM: jeden rezervační kalendář pro každý přístroj, ve kterém celá laboratoř vidí, kdo má který termín, dřív než si ho vezme.
Domluvit 30min ukázkuUkážeme vám to na vaší vlastní tabulce.

Jak to do sebe zapadá

Šest částí laboratoře, jeden propojený záznam.

Ne šest produktů slepených integracemi. Najeďte myší na modul a uvidíte, s čím je propojený. Kliknutím ho otevřete.Ne šest produktů slepených integracemi. Klepněte na modul a uvidíte, s čím je propojený.

Deníkco se stalo Sklad Protokoly Vybavení Projekty Úkoly Štítky odkazuje na vzorek obsahuje použitou verzi uvádí přístroj patří do zakládá další krok otevře záznam vstupy kroků krok vyžaduje plány označuje

Střed celého záznamu

Laboratorní deník

Každý záznam říká, co se skutečně stalo, a odkazuje na vše, čeho se týkal: zkumavku, verzi protokolu, přístroj, projekt i další úkol. Kdo a kdy ho zapsal, se ukládá automaticky.

Promytí a nové nanesení, druhá cela

Knihovna nanesena na FC-1034 podle Nanopore ligation v3 na MinION v projektu Opakované použití cel.

Propojeno s

Otevřít: Laboratorní deník →

Co laboratoř má

Sklad

Sklady vnořené tak jako vaše mrazáky, s typovanými sloupci, povinnými poli a upozorněními na zásoby a expiraci. Importujte tabulku, kterou už máte, nebo to nechte na nás.

Sekvenační centrum · 12 položek · 34 v podskladech
▤Průtokové cely10 položek · 8 upozornění
▤Knihovní kity8 položek · 2 upozornění
▤Indexové adaptéry16 položek

Propojeno s

Otevřít: Sklad →

Jak se to dělá

Protokoly

Verzované metody rozdělené do kroků, každý se vstupy, potřebným přístrojem a výstupem. Vložíte ho do záznamu a zůstane ve verzi, kterou jste použili.

Nanopore ligation sequencing · v3
1End-prepvstup · DNA knihovna
2Ligace adaptérůTermocykler
3Promytí a počet pórůFC-1034
4NaneseníMinION

Propojeno s

Otevřít: Protokoly →

Na čem to běželo

Vybavení

Každý přístroj s manuály, servisní historií a rezervačním kalendářem. Přístroj uvedený v kroku protokolu je ten, který si rezervujete.

Termocykler · září

Propojeno s

Otevřít: Vybavení →

Proč se to dělalo

Projekty

Výzkumné linie s členy, podprojekty a vlastní viditelností. Záznamy i úkoly se sbíhají do projektu, ke kterému patří.

Opakované použití průtokových cel
▤Záznamy12
▤Otevřené úkoly3
▤Členové4
▤Podprojekt · QC pórůsoukromý

Propojeno s

Otevřít: Projekty →

Co bude dál

Úkoly

Plány, sloupce a karty s řešitelem, termínem a checklistem. Záznam může založit další krok a vše, co máte přiděleno, je na jedné stránce.

Sestavení genomu

Propojeno s

Otevřít: Úkoly →

Z regálu rovnou do záznamu

Štítky

NFC štítky a čárové kódy na zkumavkách a krabičkách. Přiložíte telefon a otevře se záznam se všemi pokusy, ve kterých byl použit. 500 ročně je v ceně.

Naskenováno · SPC-0141
PoložkapGG-A-35S
Pozice-20 °C · Box 3
VlastníkJiří Hermann
Použito v4 záznamech

Propojeno s

Otevřít: Štítky →

Převod dat v ceně

Laboratoř do SLIMu přestěhujeme my. Vy jen pošlete soubory.

Laboratorní software většinou ztroskotá na převodu dat, když někdo musí přesunout roky tabulek a nikdo na to nemá čas. Proto to uděláme za vás. Je to v ceně a zůstaneme s vámi, dokud SLIM nepoužívá celá laboratoř.

Vaše část

  • Pošlete soubory, tak jak jsou
  • Zkontrolujete vzorek výsledku
  • Přijdete na jedno školení

Naše část

Všechno ostatní.

  • Vyčistíme a zmapujeme vaše data
  • Postavíme sklad a upozornění
  • Převedeme vše, i papírové záznamy
  • Proškolíme laboratoř i správce
  • Jsme k dispozici i po spuštění

Jak stěhování probíhá

  1. 1Vy

    Pošlete nám soubory

    Tabulky, mapy mrazáků, papírové poznámky. Klidně nepořádné.

    Ozveme se s tím, co jsme v nich našli.

  2. 2My

    Postavíme váš SLIM

    Typované sloupce, jednotky, identifikátory a upozornění podle limitů, které vaše laboratoř skutečně používá.

    Vy tady nemusíte dělat nic.

  3. 3Společně

    Společná kontrola

    Vy zkontrolujete vzorek, my opravíme, co nesedí.

    Hotovo je, až to řeknete vy.

  4. 4My

    Spuštění a školení

    Jedno školení pro laboratoř, jedno pro správce, česky nebo anglicky.

    Pak přímá linka k nám, žádné tikety.

Domluvit 30min ukázkuPošlete předem tabulku a na hovoru uvidíte, jak ji převedeme.

Skutečná cena tabulek

Vaše tabulka je tikající bomba. Otázka není jestli, ale kdy.

Funguje, dokud někdo nepřepíše sloupec, nesmaže čtyřicet řádků nebo neodejde s jedinou verzí, které kdo rozumí. A vždycky se to stane v den, kdy si to můžete dovolit nejméně.

  1. Tabulka
  2. Stejné řádky s pravidly

Soubor, na kterém laboratoř skutečně jede, zamčený tím, kdo ho otevřel první.

List1 · naposledy uložil Jiří
nameText · required concMeasurement locDropdown expDate · alerts whoPerson
pGG-A-35SpGG-A-35S 50 ng/ul50 ng/µL -20 box3-20 °C · Box 3  Required JHJiří Hermann
pGGB003pGGB003 50ng/µl50 ng/µL -20, box 3-20 °C · Box 3 12/2612 Dec 2026 JirkaJiří Hermann
Amp stockAmpicillin stock 100100 mg/mL fridge4 °C · Door 3.11.263 Nov · 67 days ?Required
Col-0 seeds 2024Col-0 seeds 2024  Required seed roomSeed room · Shelf 2  1 Sep 2027  Viktor Šimek
primer_M13FPrimer M13F 100uM100 µM -20 boxA-20 °C · Box A 202630 Jun 2027 ask JanaHelena Marešová
V tabulce
V SLIMu
Dva lidé upravují naráz, jeden přepíše druhého a vznikne _FINAL_v3.
Každá změna se uloží i s autorem a časem. Nic se neztratí.
Zmizí čtyřicet řádků a půl roku si toho nikdo nevšimne.
Nic se nemaže, jen archivuje, a vždy se to dá obnovit.
Postdok, který tabulku vymyslel, odejde a logika s ním.
Struktura je součástí systému a platí pro všechny, ať kdo přijde nebo odejde.
Půlce řádků chybí vlastník, datum nebo umístění.
Povinná pole. Napůl vyplněný záznam nejde uložit.
Nikdo si nevšimne, že antibiotikum příští týden expiruje.
Upozornění na expiraci a nízké zásoby dorazí celé laboratoři včas.
Pokus na „řádek 47“ neodkážete.
Každý vzorek má trvalé ID, na které deník odkazuje.

Na rychlé analýzy je tabulka pořád skvělá, proto SLIM kdykoli exportuje zpět do Excelu.

Každý měsíc čekání nepořádek roste.

Víc řádků k rozmotání, víc znalostí jen v hlavách lidí, víc příležitostí, že se něco ztratí. Převod dat děláme my v každém případě, takže nejlepší čas na přechod je dřív, než se pokazí další věc.

Pošlete nám svou tabulkuNa 30minutovém hovoru vám ukážeme vaši laboratoř v SLIMu.

Jedna cena za celou laboratoř. Ne za každého člověka.

Vedoucí, postdoci, studenti, laborant i hostující spolupracovník. Přidat člověka nikdy nic nestálo a nestát nebude. Desetičlenná laboratoř zaplatí při roční platbě 48 000 Kč ročně. Nástroje s cenou za uživatele si tolik obvykle řeknou za pár licencí.

Laboratoř
5 000 Kč4 000 Kč5 000 Kč / měsíc za laboratoř

Při roční platbě 48 000 Kč ročně. Ušetříte 12 000 Kč.Platba měsíčně. Při roční platbě ušetříte 20 %.

Celá laboratoř, neomezený počet lidí. Na fakturu, v případě potřeby i proti objednávce.

  • Převod vašich tabulek a školení v ceně
  • Deník, sklad, protokoly, vybavení, projekty, úkoly
  • Neomezeně uživatelů, žádné licence na osobu
  • 500 NFC štítků a čárových kódů ročně
  • Úplná historie změn, export kdykoli
Domluvit 30min ukázku
Instituce
Na míru

Více laboratoří nebo provoz na vaší vlastní infrastruktuře. Cena za laboratoř klesá s každou další laboratoří z ústavu.

  • Množstevní cena pro více laboratoří
  • Vlastní hosting, instalaci zajistíme my
  • Role napříč celou organizací
  • Konkrétní kontaktní osoba, která odpovídá
Ukázka pro instituci

Každá laboratoř začíná zkušebním provozem zdarma, který běží, dokud není vše nastavené. Bez odpočtu a bez karty. Studenti: váš osobní deník je zdarma.

Než si ukázku domluvíte: na co se ptá každý.

Dostaneme svá data zase ven?

Ano, všechna, kdykoli a bez ptaní. Sklady do CSV, záznamy do PDF a Markdownu, celý deník v jednom souboru. Raději vás udržíme tím, že budete spokojení, než tím, že vám odchod ztížíme.

Můžeme SLIM provozovat u sebe?

Ano, s kompletním produktem bez omezení. Běží na infrastruktuře vašeho ústavu, instalaci i podporu zajistíme my a cenu stanovíme podle konkrétního nasazení. Stačí se zeptat.

Kdo vidí naše data?

Jen ti, které pustíte dovnitř. SLIM je v souladu s GDPR, se smlouvou o zpracování dat, případně může běžet na vaší vlastní infrastruktuře. O přístupu rozhoduje pět rolí: vlastník, administrátor, vedoucí laboratoře, přispěvatel a čtenář. Jednotlivé deníky, projekty i protokoly mohou být soukromé.

Moji lidé to nebudou používat. Co potom?

To je skutečné riziko a bereme ho jako své. Převedeme vaše data včetně toho, co je jen na papíře, a laboratoř proškolíme. Zkušební provoz mezitím běží. Pokud se SLIM opravdu neujme, přišli jste o pár schůzek.

Je SLIM celý v češtině?

Ano. Celé rozhraní je česky i anglicky, přepínatelné pro každého uživatele, a podpora i školení jsou v češtině. Jsme malý tým z Prahy, takže mluvíte přímo s lidmi, kteří SLIM vyvíjejí.

Jak dlouho trvá nastavení?

Laboratoře jsou v průměru v ostrém provozu do měsíce, včetně převodu dat a školení. Funkční sklad obvykle zabere dny, ne týdny, podle toho, kolik dat pošlete a jak jsou uspořádaná.

Vaše laboratoř v SLIMu, za 30 minut.

Pošlete nám před hovorem tabulku. Postavíme z ní váš sklad, živě vás jím provedeme a zůstane vám, ať budete pokračovat, nebo ne.

Domluvit 30min ukázkuCeník